主恩堂以神的话语为一切事奉的基础和生命建造的根基，查考圣经在教会事工中占极重要的位置。目前定期查经分两种聚会形式：

一是以家庭小组为单位，小组每月聚会时查经是主要项目，查经内容以主题形式，目的是帮助慕道朋友和初信弟兄姐妹更多明白圣经真理。

二是以团契为单位，每周固定聚会，有系统地，整卷书地查考学习神的话语。其中包括UD学生团契，职青团契，教会周五团契，恩爱查经小组，北威明顿周五查经班，周二姐妹会，周二查经小组等。除了查经外，聚会时还包括诗歌敬拜，查经讨论，分享交流，彼此代祷等等。借着团契生活，以神的爱彼此建造，以生命影响生命。